К системам вентиляции медицинских учреждений предъявляют особые требования в части обеспечению нормируемых показателей микроклимата и воздушной среды. Медицинская вентиляция исключает протекание воздуха из «грязных» зон в «чистые», часть помещений отделяются шлюзами с автономной системой вентиляции, медицинские системы вентиляции должны обеспечивать требуемый уровень шума, кратность воздухообмена, температуру помещений, скорость движения воздуха, как правило исключена рециркуляция воздуха.
Для секций реанимации, операционных блоков, блоков интенсивной терапии и некоторых других помещений предусматриваются самостоятельные системы приточно-вытяжной вентиляции. Вентиляция боксов инфекционных отделений должна создавать максимально изолированный воздушный режим. Требования к вентиляции и кратности воздухообмена для всех кабинетов и помещений определяются разделом «Медицинская технология».